aminoXpress是一種先進的CAD應用程序,其目的是幫助生物化學家使用常規(guī)協(xié)議或構件和相應的計數(shù)輸入序列。另外,它能夠處理復雜的,分支的,循環(huán)的和冗長的序列。
用戶界面
該工具顯示了完整的功能陣容,但是您可以嘗試使用許多配置設置,因此您需要花費一些額外的時間才能了解其工作原理。
軟件功能
您可以查看幫助手冊,其中包含有關程序功能的詳細信息。您可以遵循幾個重要的步驟來處理數(shù)據(jù):將序列加載到工作區(qū)中,研究單輸入模塊中的序列(例如分子量),在工作環(huán)境中切換加載的序列,以及分析多輸入模塊中的序列。
可以在生物化學領域中使用的分析模式
aminoXpress使您可以輸入要包含在優(yōu)化程序中的那些殘基的氨基酸分析結果,并選擇首選方法(最小二乘,最小差異,差異/計數(shù)) 。
此外,您可以構建塊組成并使用組合掃描或蒙特卡洛選擇用于對數(shù)據(jù)進行排序的方法,提交蛋白質或肽段序列進行消化,啟用元素分析并輸入要分割的序列。
該程序可幫助您計算一個文庫的分子量,它們的分布及其隨機部分的組合,自動找出那些常見的基序并按出現(xiàn)的頻率對其進行排序,以及通過使用氨基酸,片段和元素來計算化合物的分子量。建筑模塊。
最后但并非最不重要的一點是,您可以將所有輸入字段的氨基酸從一個字母代碼自動切換為三個字母代碼,管理存儲在所有數(shù)據(jù)庫中的信息(您可以添加,更改或刪除所選數(shù)據(jù)庫),備份數(shù)據(jù)庫,并打印信息。
底線
總而言之,aminoXpress具有一些強大的功能,可用于生物化學領域。不利的一面是,GUI無法描述為高度直觀。