fastpcr是款專業(yè)的PCR引物設(shè)計工具。它能夠為用戶提供全面專業(yè)的設(shè)施設(shè)計,用于分析硅片,pcr集成工具環(huán)境,PCR引物或探針設(shè)計等。有需要的用戶不要錯過了。
使用說明:
FastPCR軟件是一個集成工具環(huán)境,提供全面和專業(yè)的設(shè)施,可用于設(shè)計用于標(biāo)準(zhǔn),長距離,反向,實時PCR(LUX和自我報告),多重PCR,Xtreme鏈反應(yīng)(XCR)重疊延伸PCR(OE-PCR)多片段組裝克隆和LAMP(環(huán)介導(dǎo)的等溫擴增);組合特異性(用于遺傳相關(guān)DNA序列的通用引物)或獨特(每種遺傳相關(guān)DNA序列的特異性引物); 單引物PCR(從緊密定位的反向重復(fù)序列設(shè)計PCR引物),自動檢測SSR基因座和直接PCR引物設(shè)計,氨基酸序列簡并PCR,聚合酶鏈組裝(PCA),設(shè)計跨越感興趣的區(qū)域以及更多。
用于全基因組或者染色體列表的“ in silico ”(虛擬)PCR引物或探針?biāo)阉骰蛘哂嬎銠C模擬PCR,或者可能的PCR產(chǎn)物的預(yù)測以及指定引物或探針的潛在錯配位置的搜索。在一定范圍內(nèi)同時搜索多個目標(biāo)。“ in silico ”寡核苷酸搜索有助于在溫度解鏈和PCR退火溫度計算中發(fā)現(xiàn)目標(biāo)結(jié)合位點。
長寡核苷酸可以設(shè)計用于微陣列分析和雙標(biāo)記寡核苷酸用于探針如分子信標(biāo)。
全面的引物測試,標(biāo)準(zhǔn)和簡并寡核苷酸的解鏈溫度計算,引物的PCR效率和語言復(fù)雜性,稀釋和重懸計算器。
針對所有引物二級結(jié)構(gòu)分析引物(探針),包括與Watson-Crick堿基配對(如G / C-四聯(lián)體或搖擺堿基對(如GG,GT,GA),發(fā)夾,自身二聚體和交聯(lián)劑)二聚體引物對。該軟件針對所有工具使用正常引物和退化引物的組合,并且熔化溫度計算基于最近鄰熱力學(xué)參數(shù)。
FastPCR具有處理長序列和核酸或蛋白質(zhì)序列組的能力,并且允許每個給定序列的個體任務(wù)和參數(shù)以及加入多個不同的任務(wù)以進行單次運行。它也允許序列編輯和數(shù)據(jù)庫分析。
通過可視化技術(shù)開發(fā)并應(yīng)用于程序的各種類型重復(fù)的高效和完整檢測。
該程序包括各種生物信息學(xué)工具,用于分析具有GC或AT偏斜,CG%和GA%含量以及嘌呤 - 嘧啶偏斜的序列,語言序列的復(fù)雜性; 一代隨機DNA序列,限制性I-II-III型酶和歸巢核酸內(nèi)切酶分析,尋找或創(chuàng)建編碼序列的限制酶識別位點,支持序列聚類和共有序列的產(chǎn)生以及序列的相似性和保守性分析。